竞价类型:(略)
竞价编号:(略)
结束时间:(略)
商品名称人源组织及细胞样品LC-MS非靶向代谢组学全谱检测
商品规格暂无
品牌(略)
货号(略)
采购数量180
商品单位例
采购要求1.技术服务的目标:使用LC-MS分析平台对样品进行检测,并提供详细的实验报告。 2.技术服务的内容:代谢物提取;LC-MS检测;基础数据分析。 3.技术服务的方式:通过提取代谢产物,采用LC-MS检测代谢产物,并通过数据库比对,识别代谢产物,对数据进行分析后交付。 4. 基本要求: (1)检测内容:180例人源组织及细胞样品LC-MS非靶向代谢组学全谱检测。 (2)检测平台:二维超高压液相色谱-轨道离子阱质谱联用仪(2D UPLC-Orbitrap MS)。 (3)数据库:拥有自建标准品数据库达****种以上物质。 (4)检测方法:每份样本应采用不少于五种独立进样方法检测(反相柱正离子方法、反相柱负离子方法、亲水柱负离子方法、脂质组正离子方法以及脂质组负离子方法)。 (5)实验过程管理: ①、空白(监测仪器背景信号) ②、样本前处理时插入混合同位素内标标准品(监测仪器稳定性) ③、每10个样本插入混合样品即QC样品(监测仪器及实验操作稳定性) ④、每10样本插入标准血清QC(以实现批次间数据整合) ⑤、区块随机化取样 ⑥、提供QC数据校正算法及软件 (6)鉴定代谢物数量:非靶向筛查800-****种代谢物,全部为标准品定性,不接受搜库定性。 (7)数据质量:质控样本之间的总体变异方差在3倍标准差(SD)之内,并且质控样品中85%以上数据批次内CV≤20%。 (8)数据分析:原始数据以 compound discoverer 2.1软件进行峰识别、峰对齐、基线校正及峰面积归一化等处理,最后输出包含碎片离子信息的数据矩阵。根据代谢物的质荷比和峰面积通过自建代谢物质谱数据库对代谢物进行结构定性,将数据矩阵中的缺失值使用80%去值原则进行处理,之后以自编R语言软件进行模式判别分析。对不同方法检测重叠的代谢物进行去冗余。根据偏最小二乘判别分(PLS-DA)得到的变量权重值(Variable important projection,VIP)筛选VIP>1的化合物,并结合SPSS23.0进行非参数检验,通过错误发现率(FDR)校正,筛选候选的代谢标志物,并进行代谢物富集分析及通路分析。
要求文件暂无