采购标段信息

公告内容

• 致病菌识别网菌株测序询价采购公告

  ****控制中心现就致病菌识别网菌株测序进行公开询价采购，欢迎具有相关资格的企业或供货商报名参加。

  一、招标编号：****

  二.供应商资格要求：

  1.企业法人营业执照（三证合一）副本扫描件；

  2.法定代表人身份证（正、反面复印件）；

  3.提供企业法人针对本次招标的授权函（原件）及被授权人身份证（正、反面复印件）；

  4.供货商具备第III类医疗器械经营许可证；

  5.供应商具有质量管理体系认证证书；

  6.上述资质复印件必须加盖投标商公章。

  三、招标报名及竞价时间：

  1.招标报名：2023年11月8日17:00至2023年11月9日17:00

  2.资质审核：2023年11月9日17:00至2023年11月9日18:00

  3.竞价时间：2023年11月10日8:30至2023年11月10日10:30

  四、联系方式：

  招标单位：****

  地 址：**省**建设西路672号

  联 系 人：杨坤合

  联系电话：173****7689

  五.相关事宜

  1.本公告在**省阳光采购平台上发布

  2.本次定标在所有资质和参数符合的条件下低价确定供应商（包括邮寄等费用）；

  3.报价单须有报价单位、联系人及电话，并加盖公章；

  4.****中心检验科联系（巩芳芳0937-****773）；

  5.接到中标通知2个工作日之内签订协议，10个工作日内完成服务；

  6.交货地****中心

  序号	物品名称	规格/型号/参数	单位	数量	备注
  1	10株致病菌测序ont平台完成图	1、原始测序数据的质控;2、高质量数据获取;3、基因组序列拼装与分析;4、蛋白编码基因预测;5、质粒序列比对;6、非编码 RNA 预测;7、其他非编码RNA 预测;8、CRISPRs 预测;9、重复序列预测;10、原噬菌体预测;11、基因岛预测;12、致病菌毒力因子（VFDB）分析;13、抗生素抗性（CARD）分析;14、碳水化合物活性酶（CAZy）分析;15、信号肽预测;16、跨膜螺旋预测;17、蛋白编码基因的序列比对;18、蛋白编码基因的 GO 注释;19、蛋白编码基因的eggNOG 注释;20、蛋白编码基因的 KEGG 注释;21、蛋白编码基因的 Swiss-Prot 注释;22、Pfam注释;23、TCDB 注释;24、PHI 注释;25、基因组圈图绘制;26、MLST分析;	份	10	中标商测序数据按时交给****控制中心，若中标商提供测序数据及分析不合格，中标商需免费再次测序，直到数据****控制中心满意可以正常使用为止。
  2	61株致病菌测序框架图	1、原始测序数据的质控;2、高质量数据获取;3、基因组序列拼装与分析;4、蛋白编码基因预测 ;5、非编码 RNA 预测 ;6、其他非编码 RNA 预测 ;7、CRISPRs 预测 ;8、蛋白编码基因的序列比对;9、蛋白编码基因的 GO 注释 ;10、蛋白编码基因的 eggNOG 注释 ;11、蛋白编码基因的 KEGG 注释 ;12、蛋白编码基因的 Swiss-Prot 注释;13、致病菌毒力因子分析;14、抗生素抗性（CARD）分析;15、fusA基因;	份	61
  3	40份样品中真菌菌群分析（ITS扩增子测序）	一、测序数据预处理 1. 原始测序数据预处理 2.序列去噪或聚类 3.物种分类学注释 4.构建系统发育树5.ASV/OTU 表抽平 二、物种组成分析 1. 分类单元数统计 2.分类学组成分析 3.分类等级树图 4.GraPhlAn进化树图 5.Krona 物种组成图 三、Alpha 多样性分析1.Alpha 多样性指数 2.稀疏曲线 3.物种累积曲线 4. 丰度等级曲线 四、Beta 多样性分析 1.距离矩阵与PCoA 分析 2.NMDS 分析 3.UPGMA 聚类分析 4.组间距离显著性分析 5.Adonis 差异分析 五、物种差异分析与标志物种筛选 1.ASV/OTU 韦恩图或花瓣图2.物种组成热图 3.PCA 主成分分析4.MetagenomeSeq 分析 5.LEfSe 分析 6.OPLS-DA 分析 7.随机森林分析 六、关联网络分析 1.关联网络分析与展示 七、菌群代谢功能预测 1.PICRUSt2 分析2.功能单元 PCoA 分析 3.代谢通路统计 4.代谢通路差异分析 5.差异通路的物种组成	份	40

  六、参数及数量

  ****控制中心

  2023年11月8日