技术参数及配置要求 | 型号：PowerEdge R7625 处理器: AMD EPYC 9684X 2.55Ghz, 96C/192T, 1152M 缓 存 (360W) DDR5-4800 *2 内存：96GB RDIMM, 4800MT/s 双列*24 硬盘：960GB 固态硬盘 SATA 读取密集型 6Gbps 512 2.5英寸热插拔 AG 硬盘, 1 DWPD *4 网卡：万兆光口+千兆电口 GPU：NVIDIA RTX4090 *2 文件系统：lustre分布式文件系统，基于ldiskfs文件系统，需要更改内核，支持双机热备（目前单机，将来双机，高可用Corosync、pacemaker） 操作系统：支持多版本Linux操作系统同时工作，并可按需动态调配不同的节点集合启用基于不同操作系统版本的运行环境。可多节点的映像实现强一致性，各节点的操作系统，驱动程序，环境配置实现版本和设置的一致性。创建本地rocky8或者rocky9的yum源，其中包含epel源，节点在正常关机或非正常关机的情况下，均不会导致映像损坏，重新启动后可以自动加载映像并正常启动操作系统 能够通过集中的配置文件为所有节点统一定义和生成主机名、配置IP地址，加载配置文件，并根据主机名对节点进行任意分组。计算节点具备裸机加电条件即可工作，无需在计算节点上安装任何系统软件和应用软件。 节点在重新启动后可以自动加载设置给此节点的配置信息，如主机名称，IP地址等在操作系统基础上自动实现内核映像定制和优化。可预定义规则并在线修改节点角色，可实现节点角色生效后自动切换。 系统环境：1、编译环境：Intel 2018，2019，2021，2022，2023编译器 GCC 8.3，8.5，9.5，10.4,11.4，12.3，13.2 Openmpi 3.1.6,4.0.7,4.1.6,5.0 Mpich 3.4.3 4.1.2 Java jdk 11，12，17，21 Automak 1.14.1，1.15，1.16.5 Autoconf 2.59，2.65，2.71 Cmake 3.15.7，3.26.5，3.28.0 Qt 5.12.12，5.15.0Boost 1.69， 1.70 2、虚拟环境：署安装singularity，提供singularity作业脚本，提供脚本截图，在集群部署安装vmare，qemu和virtualbox，安装多系统多版本虚拟机 3、人工智能环境：部署安装nvhpc_2022_2211 nvhpc_2022_225 nvhpc_2023_231 nvhpc_2023_235 nvhpc_2023_237 nvhpc_2023_239，cuda11.0 cuda11.8 cuda11.4 cuda12.0 cuda12.1 cuda12.2，以及对应版本的cudnn 部署安装nvidia-fabricmanagernv_peer_mem nvidia-dcgm 部署安装transformers-benchmarks Tensorflow，Keras，Pytorch，Transformers等深度学习框架 4、集群调度：支持集成Slurm或者OpenPBS。支持多架构CPU、GPU等计算**的调度功能。提供深度学习作业调度、模板管理、作业提交、配额管理、**预约、失效调度、调度策略、队列管理、作业操作等功能 5、支持监控集群CPU、GPU、内存、存储等**的利用状态；支持服务器GPU、功耗、温度显示；支持作业状态、节点状态显示； 6、用户管理：管理员通过命令行进行集群用户管理，在命令行页面具有用户创建、删除等功能，用户/组管理：集群用户/用户组的创建，显示，修改和删除；账户的管理包括账户的创建，显示，修改和删除；创建子账号，关联主账号的文件配额，任务配额和资费 7、认证系统：提供统一的身份认证功能，包括oAuth，cas，ldap，nis，password文件，数据库等。 生信软件：1、R安装：3.4.4，3.5.3，3.6.0，4.0.0，4.1.1，4.2.0，4.3.1 需安装BiocManager包 安装Rstudio，创建桌面图标，实现点击既可调用不同版本的R，截图证明2、生信：abyss，ascp，bamtools，Bcftools，bedtools，blast，blat，bowtie2，breakdancer，Bwa，bwtool，cactus，canu，CATH Tools，CCMpred ，cellranger，cufflinks，Cutadapt，deeptools，delly，DESeq2，EDTA，Dip-c，emboss ，ensembl vep，exonerate，fastx_toolkit，fftw，freebayes，Freec，GATK4，GenomeTools，ghostscript，Glnexus，gmap，gradle，GraphicsMagick，Grinder，gsl，hdf5，HiC，HiCPlotter，hisat2，hmmer，Homer，HTSeq，htslib，igraph，ImageMagick，INSPIIRED，interproscan，kmergenie，KOBAS，lachesis，La Jolla Assembler，LIANTI，libpng，lumpy，MACS2，Madeline_2.0_PDE，magicblast，meme，MERLIN，MiniMac4，miso，mummer ，Nextomics/NextDenovo，nextstrain-auspice/augur，ngmlr，ngsplot，ocaml，parallel，perl5bio，perl5bio.sh，PhyloCSF，phylogibbs，Picard，Piranha，plotutils，primer3，PyPore，QIIME 2，quickmerge，racon，RepeatMasker，RMBlast，REPET，root， Samtools，scrublet，Segmental Duplication Assembler，Seurat，snpEff，SOAPdenovo2，speedseq，sratoolkit，STAR，stringtie，Structural Variation Engine (SVE)，Tandem Repeats Finder，telomerecat，tmux，tophat，torch.，trinityrnaseq，TRUST4，VAST-TOOLS，vcftools，weblogo，wfmash，zeromq 3、NetCDF，HDF5含Intel和gcc编译的版本 4、安装正版amber18，amber22，CP2K，dl_binder_design，gromacs2018，gromacs2021，gromacs2022，modeller，mfold，autodock，dock6，alphafold2.2，alphafold2.3，ligbuild，LocalColabFold rosetta 系统环境：1、编译环境：Intel 2018，2019，2021，2022，2023编译器 GCC 8.3，8.5，9.5，10.4,11.4，12.3，13.2 Openmpi 3.1.6,4.0.7,4.1.6,5.0 Mpich 3.4.3 4.1.2 Java jdk 11，12，17，21 Automak 1.14.1，1.15，1.16.5 Autoconf 2.59，2.65，2.71 Cmake 3.15.7，3.26.5，3.28.0 Qt 5.12.12，5.15.0Boost 1.69， 1.70 2、虚拟环境：署安装singularity，提供singularity作业脚本，提供脚本截图，在集群部署安装vmare，qemu和virtualbox，安装多系统多版本虚拟机 3、人工智能环境：部署安装nvhpc_2022_2211 nvhpc_2022_225 nvhpc_2023_231 nvhpc_2023_235 nvhpc_2023_237 nvhpc_2023_239，cuda11.0 cuda11.8 cuda11.4 cuda12.0 cuda12.1 cuda12.2，以及对应版本的cudnn 部署安装nvidia-fabricmanagernv_peer_mem nvidia-dcgm 部署安装transformers-benchmarks Tensorflow，Keras，Pytorch，Transformers等深度学习框架 4、集群调度：支持集成Slurm或者OpenPBS。支持多架构CPU、GPU等计算**的调度功能。提供深度学习作业调度、模板管理、作业提交、配额管理、**预约、失效调度、调度策略、队列管理、作业操作等功能 5、支持监控集群CPU、GPU、内存、存储等**的利用状态；支持服务器GPU、功耗、温度显示；支持作业状态、节点状态显示； 6、用户管理：管理员通过命令行进行集群用户管理，在命令行页面具有用户创建、删除等功能，用户/组管理：集群用户/用户组的创建，显示，修改和删除；账户的管理包括账户的创建，显示，修改和删除；创建子账号，关联主账号的文件配额，任务配额和资费 7、认证系统：提供统一的身份认证功能，包括oAuth，cas，ldap，nis，password文件，数据库等 |
换一批
换一批