深圳大学 - 竞价公告(CF105902024001198)
**** - 竞价公告(****)
发布时间:2024-09-27 15:36:45 截止时间:2024-10-12 12:00:00
申购主题: 600例样本常规转录组测序
报价要求: 国产含税
发票类型: 增值税普通发票
付款方式: 验收合格后付款
收货地址: **省/**市/**区/****
供应商资质:
备注说明:
送货时间: 3年
安装要求: 免费上门安装(含材料费)
预算: 192000.0人民币
600例样本常规转录组测序 | 1.0/批 | 192000.0 | 1、技术目标 利用Illumina测序平台完成600例样本转录组测序,测序模式为PE150,20M reads/样品,数据质量Q30>85%。 2、技术方法和路线 2.1 RNA提取:利用CTAB法或商品化试剂盒提取RNA,提取后在Nanodrop和Agilent 2100仪器上进行质检,当RNA浓度≥40ng/ul,总量≥1ug,RIN≥6.0时,判定为合格。 2.2 文库构建及测序:按照mRNA-seq文库的标准流程构建文库,文库构建完成后,使用Qubit 3.0进行初步定量,并使用qPCR准确定量。库检合格后,使用Illumina测序平台进行PE150模式测序。 2.3 数据质控标准: 测序FASTQ文件生成后进行初级质控,质控规则如下: 1)当单端测序reads中N个数>3时,去除此对paired reads; 2)当单端测序read中质量值低于5的碱基比例>=20%时,去除此对paired reads; 3)去除adapter序列。 3、周期 3.1.收到样本及信息单的次日起计算,在5个工作日内完成样本提取质检,并提供相应的质检报告。 3.2.在完成提取质检后的14个自然日内完成建库及数据产出,并利用技术路线中的质控标准进行数据质控。 | 1.按行业标准提供服务; 2.测序服务达到以下要求: 提取质检合格后在Illumina平台测序,20M reads/样品,Q30>85%,未达到要求的,重新补测。 |
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