安溪特异茶资源鲜叶转录组测序（EJWJ2024373）采购公告

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安溪特异茶资源鲜叶转录组测序（EJWJ2024373）采购公告

更新时间	2024年11月04日
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特异茶鲜叶转录组测序	****
2024-11-04 15:48:04	2024-11-07 17:00:00
****	货到验收付款


￥48100.00





符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件

采购清单1

采购商品采购数量计量单位所属分类

溪特异茶**鲜叶转录组测序

项

技术测试和分析服务

品牌型号预算单价技术参数及配置要求参考链接售后服务

￥ 48100.00

一、分析内容：转录组： 1.数据质控：对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads 的处理 2.比对分析：比对核糖体序列、参考基因组（或其他参考序列） 3.基因分析： 1) 新基因鉴定 2) 基因类型统计 3) 基因覆盖度统计 4) 测序饱和度分析 5) 基因测序随机性分析 4.基因表达量统计（表达量计算，表达量丰度分布） 5.样本关系分析（基于表达量） 1) 主成分分析（PCA） 2) 相关性系数热图 6.组间差异分析（至少两个分组，每个分组两个或两个以上样品） 1) 差异基因整体统计 2) 差异比较火山图 3) 差异基因聚类热图 4) 差异基因GO富集分析（富集圈图、富集气泡图、柱形图绘制、差异富集气泡图、富集条形图） 5) 差异基因KEGG富集分析（富集圈图、富集气泡图、柱形图绘制、差异富集气泡图、富集条形图） 6) 差异基因Reactome富集分析（富集圈图、富集气泡图、柱形图绘制、差异富集气泡图、富集条形图，仅限部分物种） 7.互作网络分析（PPI分析） 1) String数据库蛋白互作网络分析 2) 网络图绘制 8.GSEA分析 (Gene Set Enrichment Analysis)（需要每个分组有3个或以上生物学重复样品） 1) 基于GSEA的GO富集分析 2) 基于GSEA的KEGG富集分析 3) 基于GSEA的Reactome富集分析（仅限部分物种） 9.趋势分析（需要三个或以上有处理梯度的样品） 10.基因可变剪切鉴定基于在线报告可以调整进行的分析： 1.基因集筛选（通过基因ID、symbol、基因功能进行查找筛选） 2.样本关系分析 1) 样本间PCA分析 2) 样本间相关性热图分析 3) 样本聚类图分析 4) 重复性散点图分析 5) 小提琴图分析 6) 韦恩图分析 3.差异分析 1) 差异基本分析（差异基因的柱状图、热图、小提琴图、火山图、雷达图分析） 2) 差异基因GO富集分析 3) 差异基因KEGG富集分析 4) 差异基因Reactome富集分析（仅限部分物种） 5) 差异基因韦恩图分析 4.GSEA分析（需要每个分组内有3个或以上生物学重复样品） 5.目标基因分析 1) 目标韦恩图分析 2) 目标热图分析 3) 趋势分析 4) 目标GO富集分析 5) 目标KEGG富集分析 6) 目标Reactome富集分析（仅限部分物种） 7）转录因子靶向分析 8）目标基因PPI分析 9）目标可变剪切模式图 6.基因序列分析 1) Blast分析 2) 序列查询 3）基因Reads分布图 7. 转录因子分析 8. WGCNA在线报告分析（至少10个样本） 1) 模块划分（Power值曲线、模块特征值聚类图、模块层级聚类图、模块总览） 2) 样本分析（样本内基因分布、样本内模块表达） 3) 模块分析（模块-模块关系分析、模块-基因关系分析、模块内GO富集分析、模块内KEGG富集分析） 4) 基因调控网络图 5) 性状与模块关联分析 6) 性状与模块MM-GS分析（性状与模块GS分析、MM-GS相关性、Kin与GS关联分析）二、其他要求：转录组提供可交互性在线分析平台，后续可以在平台上进行个性化分析调整，平台不限制使用期限；在线报告平台稳步运营5年以上，引用发表文章上千篇；配备专业的技术人员进行售后，对提出的问题响应时间在48h内，且不限制时间次数。不允许进行分包，公司需有测序资质。

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